O Comitê de Ética em Pesquisa (CEP) é um colegiado interdisciplinar e independente, que deve existir nas instituições que realizam pesquisas envolvendo seres humanos. Tem por objetivo defender os interesses dos sujeitos da pesquisa em sua integridade e dignidade e para contribuir no desenvolvimento da pesquisa dentro de padrões éticos. O CEP do Centro Universitário Atenas (CEP/ATENAS) foi instituído pela Portaria Normativa n° 053 de 10 de julho de 2010, em consonância com o que determinam as Resoluções nº466/2012 e nº580/2018 do Conselho Nacional de Saúde e Norma Operacional 001/2013 do Ministério da Saúde.
A composição do Comitê de Ética em Pesquisa com Seres Humanos do Centro Universitário Atenas é realizada mediante a indicação de professores/pesquisadores dos campi Paracatu, Passos e Sete Lagoas, e por representantes da sociedade civil, que são indicados pelo Conselho Municipal de Saúde. A composição do Comitê necessariamente deve ser interdisciplinar.